马拉维湖和东非大裂谷一样是由于强烈的地壳断裂运动形成的,这一地区的地壳处在大运动时期,整个区域出现抬升现象,地壳下面的地幔物质上升分流,产生巨大的张力,正是在这种张力的作用之下,地壳发生大断裂,从而形成裂谷.裂谷深的地方形成湖泊,这一类湖泊一般较深.