不分1、2、3、4号口
上海南站只设有东北、西北、东南、西南4个方向的进站口，和可以容纳近4000名旅客的12个候车室，以及两处软席候车室和城际列车候车室。
1至9号站台是高站台，10号和11号站台原是低站台，因配合金山铁路而改造为高站台。
