九阳神功被张无忌给埋在昆仑山的雪谷中了。
金庸先生在《倚天屠龙记》书中交代：
张无忌在练成九阳神功后，在山洞中挖了个三尺来深得洞，将九阳真经、胡青牛的医术、王难姑的毒经都埋在了洞中，并刻了六个字“张无忌埋经处”。
这里是金庸先生的一个伏笔，可以继续写射雕的第四部，然而随着金庸先生的离世，九阳神功再也没机会出世了
最后结局是张无忌将明教教主之位传与光明左使杨潇，与赵敏携手游历大好河山。
而朱元璋掌握实权拥兵百万，最后推翻蒙元，建立明朝。
《倚天屠龙记》曾舜晞版结局是曾舜晞饰演的张无忌最后和赵敏在一起了。
张无忌看破世情，抛下所有身份去寻赵敏，最后在草原找到赵敏，两人归隐了。
倚天屠龙记结局为张无忌拜别明教众人后，跟赵敏过上了幸福生活。
张无忌号令各大门派齐心协力铲除元军，元帝被迫北逃，张无忌顺利平靖天下，他回武当庆祝张三丰的寿诞，张三丰劝他去找赵敏，临走，张三丰又练了一遍太极剑，想让张无从中有所感悟。
